หลักสูตรระดับปริญญาเอกที่ CEU เป็นหลักสูตรการศึกษาที่ได้รับทุนเต็มจำนวนโดยมีระยะเวลามาตรฐาน 4 ปีที่มอบวุฒิการศึกษาระดับปริญญาจากสหรัฐอเมริกาและออสเตรีย หลักสูตรปริญญาเอกไม่มีสาขาวิชาสังคมวิทยาและมานุษยวิทยาแยกจากกัน ทั้งสองสาขาวิชาจะบูรณาการเข้าด้วยกัน นักศึกษาได้รับการสนับสนุนให้ทำการวิจัยเชิงประจักษ์โดยใช้วิธีการที่หลากหลาย อย่างไรก็ตาม แนวทางที่ได้รับแจ้งทางทฤษฎีซึ่งครอบคลุมวาระทางปัญญาที่กว้างขวางจะได้รับการจัดลำดับความสำคัญ